J o u r n a l o f R e s e a r c h i n B i o l o g y S w i n e F l u ( n o v e l H 1 N 1 ) t r a n s m i s s i o n , c o n t r o l , d i a g n o s i s a n d r e e m e r g e n c e : A n o v e r v i e w K e y w o r d s : N o v e l H 1 N 1 , t r a n s m i s s i o n , r e s i s t a n c e , r e - e m e r g e n c e , G l y c y r r h i z a . A B S T R A C T : S w i n e f l u ( A H 1 N 1 ) , a q u a d r u p l e r e a s s o r t a n t v i r u s , c a u s e s r e s p i r a t o r y i l l n e s s i n p e o p l e . I t i s a n e w i n f l u e n z a v i r u s , f i r s t d e t e c t e d i n p e o p l e i n t h e U n i t e d S t a t e s i n A p r i l 2 0 0 9 . I t i s a g l o b a l t h r e a t , a f f e c t i n g m o r e t h a n 7 0 c o u n t r i e s . T h e c a s e f a t a l i t y r a t e ( C F R ) o f t h e p a n d e m i c s t r a i n h a s b e e n e s t i m a t e d a t 0 . 4 % . I n I n d i a , 1 9 2 7 l a b o r a t o r y c o n f i r m e d c a s e s o f n o v e l i n f l u e n z a A H 1 N 1 h a v e b e e n r e p o r t e d w i t h 2 5 d e a t h s . T h e n o v e l H 1 N 1 v i r u s s p r e a d s f r o m h u m a n t o h u m a n , i n s i m i l a r w a y t h a t o f r e g u l a r s e a s o n a l i n f l u e n z a v i r u s e s , a n d t h e i r c l i n i c a l p r e s e n t a t i o n i m i t a t e s e a s o n a l f l u ; s o m e t i m e s d i a r r h e a , v o m i t i n g , s e v e r e i l l n e s s e s a n d d e a t h h a v e a l s o b e e n r e p o r t e d . T h e v i r u s i s r e s i s t a n t t o a m a n t a d i n e a n d r i m a n t a d i n e a n d s e n s i t i v e t o o s e l t a m i v i r a n d z a n a m i v i r . H o w e v e r , o s e l t a m i v i r r e s i s t a n t s t r a i n s h a v e a l s o e m e r g e d . U s e o f a p p r o v e d N 9 5 f i l t e r i n g f a c e p i e c e r e s p i r a t o r s , p o w e r e d a i r p u r i f y i n g r e s p i r a t o r s d u r i n g f l u p a t i e n t c a r e a n d m e d i c a l p r o c e d u r e s h a v e b e e n r e c o m m e n d e d . A S O 3 a d j u v a n t p a n d e m i c ( H 1 N 1 ) 2 0 0 9 v a c c i n e h a v e b e e n f o u n d e f f e c t i v e i n p r e v e n t i n g p a n d e m i c ( H 1 N 1 ) 2 0 0 9 d i s e a s e . D i f f e r e n t t e c h n o l o g i e s s u c h a s i n t r a n a s a l a d m i n i s t e r e d S A P , m u l t i m e r i c f o r m s o f t h e 2 0 0 9 A ( H 1 N 1 ) H A ( s H A ) a n d N A ( s N A ) s u r f a c e g l y c o p r o t e i n s , t y / 0 4 a t t - b a s e d v a c c i n e s , l i c o c h a l c o n e G a n d c h a l c o n e s f r o m t h e a c e t o n e e x t r a c t o f G l y c y r r h i z a i n f l a t a a r e b e i n g t h o u g h t o f a n d e x p l o r e d t o c o n t r o l a n d t r e a t i n f l u e n z a . G e n e r a l i z e d l y m p h o p e n i a , p r e f e r e n t i a l l o s s o f T h 1 7 p o p u l a t i o n a n d T c e l l a c t i v a t i o n a n d r a d i o l o g i c a l i m a g i n g h a v e b e e n i n d i c a t e d f o r e a r l i e r d i a g n o s i s . T h e p h y l o g e n e t i c s t u d i e s i n d i c a t e 2 0 0 9 n o v e l H 1 N 1 o r i g i n f r o m t h a t o f t h e 1 9 1 8 p a n d e m i c s t r a i n . U n d o u b t e d l y w e a r e h e a d i n g t o w a r d s u n r a v e l i n g t h e m y s t e r i e s o f t h e i n f l u e n z a v i r u s , b u t i t s e e m s t o b e f a r m o r e t a c t i c a l t o p r e v a i l , e m e r g e o r r e - e m e r g e . T h u s , p o t e n t i a l l y t h r e a t e n i n g c h a l l e n g e s t i l l s u r r o u n d s u s . 6 9 6 - 7 0 3 | J R B | 2 0 1 2 | V o l 2 | N o 8 T h i s a r t i c l e i s g o v e r n e d b y t h e C r e a t i v e C o m m o n s A t t r i b u t i o n L i c e n s e ( h t t p : / / c r e a t i v e c o m m o n s . o r g / l i c e n s e s / b y / 2 . 0 ) , w h i c h g i v e s p e r m i s s i o n f o r u n r e s t r i c t e d u s e , n o n - c o m m e r c i a l , d i s t r i b u t i o n a n d r e p r o d u c t i o n i n a l l m e d i u m , p r o v i d e d t h e o r i g i n a l w o r k i s p r o p e r l y c i t e d . w w w . j r e s e a r c h b i o l o g y . c o m J o u r n a l o f R e s e a r c h i n B i o l o g y A n I n t e r n a t i o n a l S c i e n t i f i c R e s e a r c h J o u r n a l A u t h o r s : R a j e s h S a w h n e y 1 , A r u n K u m a r 2 , V a n d a n a B e r r y 3 . I n s t i t u t i o n : 1 . D e p a r t m e n t o f M i c r o b i o l o g y , B h o j i a D e n t a l C o l l e g e , B u d h , B a d d i . D i s t t . S o l a n ( H . P ) . I n d i a . 2 . D e p a r t m e n t o f B i o t e c h n o l o g y , B h o j i a I n s t i t u t e o f L i f e S c i e n c e s , B u d h , B a d d i . D i s t t . S o l a n ( H . P ) . I n d i a . 3 . D e p a r t m e n t o f M i c r o b i o l o g y , C h r i s t i a n M e d i c a l C o l l e g e & H o s p i t a l , L u d h i a n a ( P b . ) I n d i a . C o r r e s p o n d i n g a u t h o r : R a j e s h S a w h n e y . E m a i l : s a w h n e y r a j e s h @ y a h o o . c o m W e b A d d r e s s : h t t p : / / j r e s e a r c h b i o l o g y . c o m / d o c u m e n t s / R A 0 2 6 0 . p d f . D a t e s : R e c e i v e d : 2 6 J u n 2 0 1 2 A c c e p t e d : 1 6 J u l 2 0 1 2 P u b l i s h e d : 2 2 N o v 2 0 1 2 A r t i c l e C i t a t i o n : R a j e s h S a w h n e y , A r u n K u m a r , V a n d a n a B e r r y . S w i n e F l u ( n o v e l H 1 N 1 ) t r a n s m i s s i o n , c o n t r o l , d i a g n o s i s a n d r e e m e r g e n c e : A n o v e r v i e w . J o u r n a l o f R e s e a r c h i n B i o l o g y ( 2 0 1 2 ) 2 ( 8 ) : 6 9 6 - 7 0 3 J o u r n a l o f R e s e a r c h i n B i o l o g y A n I n t e r n a t i o n a l S c i e n t i f i c R e s e a r c h J o u r n a l O r i g i n a l R e s e a r c h

I N T R O D U C T I O N : S w i n e f l u ( A H 1 N 1 ) , a q u a d r u p l e r e a s s o r t a n t v i r u s , c a u s e s r e s p i r a t o r y i l l n e s s i n p e o p l e . T h e W H O u p d a t e s t a t e d w o r l d ’ s p a n d e m i c f l u t o t a l a s 9 4 , 1 5 2 c a s e s w i t h 4 2 9 b e c o m i n g f a t a l ( P a n d e m i c ( H 1 N 1 ) , 2 0 0 9 ) . T h e c a s e f a t a l i t y r a t e ( C F R ) o f t h e p a n d e m i c s t r a i n h a s b e e n e s t i m a t e d a t 0 . 4 % . ( F r a s e r e t a l . , 2 0 0 9 ) . I n I n d i a , 1 9 2 7 l a b o r a t o r y c o n f i r m e d c a s e s o f N o v e l i n f l u e n z a A H 1 N 1 h a v e b e e n r e p o r t e d u p t o A u g , 2 0 0 9 w i t h 2 5 d e a t h s . ( S w i n e F l u I n d i a ) . N o v e l H 1 N 1 i s a n e w i n f l u e n z a v i r u s , f i r s t d e t e c t e d i n p e o p l e i n t h e U n i t e d S t a t e s i n A p r i l 2 0 0 9 . ( W H O , 2 0 0 9 ) . I n J u n e 2 0 0 9 , t h e W o r l d H e a l t h O r g a n i z a t i o n d e c l a r e d a p a n d e m i c o f t h e n e w v i r u s . T h e l a b o r a t o r y c o n f i r m e d c a s e s h a v e n o w b e e n f o u n d i n m o r e t h a n 7 0 c o u n t r i e s . T h e W o r l d H e a l t h O r g a n i z a t i o n h a s d e t e r m i n e d t h a t t h i s v i r u s h a s s h o w n “ s u s t a i n e d ” h u m a n t o h u m a n t r a n s m i s s i o n a n d h a s u p g r a d e d t h e p a n d e m i c a l e r t l e v e l t o 6 o n a s c a l e o f 6 . ( A P h a s e 6 d e s i g n a t i o n i n d i c a t e s t h a t a g l o b a l p a n d e m i c i s u n d e r w a y ) . ( C a l / O S H A , 2 0 0 9 ) I t i s t h r e a t t o g l o b a l p u b l i c h e a l t h . ( C D C , 2 0 0 9 ) . T h e N o v e l H 1 N 1 v i r u s s p r e a d s f r o m h u m a n t o h u m a n , i n s i m i l a r w a y t h a t o f r e g u l a r s e a s o n a l i n f l u e n z a v i r u s e s . T h i s v i r u s w a s o r i g i n a l l y r e f e r r e d t o a s “ s w i n e f l u ” b e c a u s e m a n y o f t h e g e n e s i n t h i s n e w v i r u s w e r e s i m i l a r t o i n f l u e n z a v i r u s o c c u r r i n g i n p i g s i n N o r t h A m e r i c a . B u t , t h i s n e w v i r u s d i f f e r s f r o m t h e v i r u s t h a t i s n o r m a l l y p r e s e n t i n N o r t h A m e r i c a n p i g s . I t h a s t w o g e n e s f r o m f l u v i r u s e s t h a t n o r m a l l y c i r c u l a t e i n p i g s i n E u r o p e a n d A s i a , a l o n g w i t h a v i a n g e n e s a n d h u m a n g e n e s . ( D e a d l y n e w f l u v i r u s i n U S a n d M e x i c o m a y g o p a n d e m i c , 2 0 0 9 ) . T h i s v i r u s i s r e s i s t a n t t o t h e a n t i v i r a l m e d i c a t i o n s a m a n t a d i n e a n d r i m a n t a d i n e , b u t i s s e n s i t i v e t o o s e l t a m i v i r a n d z a n a m i v i r . ( M a y o C l i n i c S t a f f , 2 0 0 9 ) . C l i n i c a l P r e s e n t a t i o n a n d T r a n s m i s s i o n : T h e c l i n i c a l p r e s e n t a t i o n o f n o v e l H 1 N 1 ( s w i n e ) f l u v i r u s i n p e o p l e i m i t a t e s e a s o n a l f l u , a n d i n c l u d e f e v e r , c o u g h , s o r e t h r o a t , r u n n y o r s t u f f y n o s e , b o d y a c h e s , h e a d a c h e , c h i l l s a n d f a t i g u e . A s i g n i f i c a n t n u m b e r o f p e o p l e w h o h a v e b e e n i n f e c t e d w i t h t h i s v i r u s a l s o h a v e r e p o r t e d d i a r r h e a a n d v o m i t i n g ( C D C ) . A l s o , l i k e s e a s o n a l f l u , s e v e r e i l l n e s s e s a n d d e a t h h a s o c c u r r e d a s a r e s u l t o f i l l n e s s a s s o c i a t e d w i t h t h i s v i r u s . T h e d i f f i c u l t y i n b r e a t h i n g o r s h o r t n e s s o f b r e a t h , p a i n o r p r e s s u r e i n t h e c h e s t o r a b d o m e n , s u d d e n d i z z i n e s s , c o n f u s i o n , s e v e r e o r p e r s i s t e n t v o m i t i n g a r e s i g n s c a l l i n g f o r e m e r g e n c y a t t e n t i o n . I n c h i l d r e n t h e i n f e c t i o n m a n i f e s t s a s f a s t b r e a t h i n g o r t r o u b l e d b r e a t h i n g , b l u i s h s k i n c o l o r , i n a d e q u a t e d r i n k i n g o f f l u i d s , n o t w a k i n g u p o r n o t i n t e r a c t i n g , b e i n g h i g h l y i r r i t a b l e . ( P a n d e m i c H 1 N 1 f l u ) . P a n d e m i c H 1 N 1 f l u s p r e a d s f r o m p e r s o n t o p e r s o n t h r o u g h c o u g h i n g o r s n e e z i n g b y i n f e c t e d p e o p l e . I t i s n o t c a u s e d f r o m e a t i n g p o r k o r p o r k p r o d u c t s . S o m e t i m e s p e o p l e m a y b e c o m e i n f e c t e d b y t o u c h i n g f l u c o n t a m i n a t e d s u r f a c e s / m a t e r i a l s , f o l l o w e d b y t o u c h i n g t h e i r m o u t h o r n o s e . ( C D C ) T h e p r e g n a n t w o m e n , i n f a n t s , c h i l d r e n a n d y o u n g a d u l t s u p t o 2 4 y e a r s o f a g e f o r m s t h e m a j o r r i s k g r o u p s . T h e p a t i e n t s w i t h a s t h m a , d i a b e t e s , k i d n e y d i s e a s e , h e a r t d i s e a s e , h a e m a t o l o g i c a l d i s o r d e r , n e u r o l o g i c a l d i s o r d e r s o r c o m p r o m i s e d i m m u n i t y a r e a t r i s k . ( C e n t e r s f o r D i s e a s e C o n t r o l a n d P r e v e n t i o n , 2 0 0 9 ) . C h i l d r e n o n l o n g t e r m a s p r i n t h e r a p y a r e a t r i s k . ( B e l l , 2 0 0 9 ) S m o k e r s , e s p e c i a l l y t h o s e w h o b r e a t h e s e c o n d h a n d s m o k e a r e l a r g e l y a t r i s k o f a c q u i r i n g t h i s i n f e c t i o n . ( C e n t e r s f o r D i s e a s e C o n t r o l a n d P r e v e n t i o n , 2 0 0 9 ) . C o n t r o l a n d P r o p h y l a x i s : “ P r e v e n t i o n i s b e t t e r t h a n c u r e ” s e e m s t o b e f i t t h e c u r r e n t s c e n a r i o . T h e s t r i c t c o m p l i a n c e t o p r e v e n t i v e m e a s u r e s n e e d t o b e f o l l o w e d t o p r o t e c t h e a l t h c a r e p r o f e s s i o n a l s a n d g e n e r a l m a s s e s . C e n t r e f o r D i s e a s e C o n t r o l ( C D C ) r e c o m m e n d s t h e u s e o f a p p r o v e d N 9 5 f i l t e r i n g f a c e p i e c e r e s p i r a t o r s d u r i n g f l u p a t i e n t c a r e a n d m e d i c a l p r o c e d u r e s . I t i s r e c o m m e n d e d t h a t h o s p i t a l i z e d H 1 N 1 f l u p a t i e n t s ( s u s p e c t e d o r c o n f i r m e d ) b e h o u s e d i n a n a i r b o r n e i n f e c t i o n i s o l a t i o n r o o m . H i g h e r l e v e l s o f S a w h n e y e t a l . , 2 0 1 2 6 9 7 J o u r n a l o f R e s e a r c h i n B i o l o g y ( 2 0 1 2 ) 2 ( 8 ) : 6 9 6 - 7 0 3

r e s p i r a t o r y p r o t e c t i o n , s u c h a s p o w e r e d a i r p u r i f y i n g r e s p i r a t o r s , s h o u l d b e c o n s i d e r e d f o r e m p l o y e e s w h o p e r f o r m h i g h h a z a r d p r o c e d u r e s , s u c h a s e n d o t r a c h e a l i n t u b a t i o n , n e b u l i z e r t r e a t m e n t , b r o n c h o s c o p y , a n d r e s u s c i t a t i o n i n v o l v i n g e m e r g e n c y i n t u b a t i o n o r c a r d i a c p u l m o n a r y . I n g e n e r a l , i n h e a l t h c a r e o p e r a t i o n s a n d o t h e r h i g h e r r i s k e n v i r o n m e n t s , a p p r o v e d r e s p i r a t o r y p r o t e c t i o n s h o u l d b e u s e d . ( P a n d e m i c H 1 N 1 f l u ) A p p l i c a t i o n o f s u r g i c a l o r p r o c e d u r e m a s k s , t i s s u e a n d h a n d h y g i e n e m a t e r i a l s s h o u l d b e u s e d i n r i s k a r e a s . F a c i l i t y c l e a n i n g , d i s i n f e c t i o n , h a n d h y g i e n e c a n c u r b t h e s p r e a d o f i n f e c t i o n . A l c o h o l - b a s e d h a n d c l e a n e r s a r e a l s o e f f e c t i v e . C l o s e c o n t a c t w i t h s i c k p e o p l e n e e d s t o b e a v o i d e d . ( U S C e n t e r s f o r D i s e a s e C o n t r o l . 2 0 0 8 ) T h o r o u g h s y m p t o m a t i c a s w e l l a s d i a g n o s t i c s c r e e n i n g f o r f l u i n f e c t i o n i s a p o t e n t t o o l t o c u r b t h e t r a n s m i s s i o n o f i n f e c t i o n . P e r s o n s w i t h s w i n e i n f l u e n z a A ( H 1 N 1 ) v i r u s i n f e c t i o n h a v e b e e n c o n s i d e r e d p o t e n t i a l l y c o n t a g i o u s f o r u p t o s e v e n d a y s f o l l o w i n g i l l n e s s o n s e t o r u n t i l s y m p t o m s a r e r e s o l v e d . T h e d u r a t i o n o f i n f e c t i o u s n e s s m i g h t v a r y b y s w i n e i n f l u e n z a A ( H 1 N 1 ) v i r u s s t r a i n . ( N o v e l H 1 N 1 N o v e l I n f l u e n z a ( S w i n e f l u ) . 2 0 0 9 ) . T h e c h e m o p r o p h y l a x i s f o r n o v e l A H 1 N 1 i n c l u d e s a n t i v i r a l a g e n t s , o s e l t a m i v i r ( T a m i f l u ) a n d z a n a m i v i r , g i v e n a t e a r l y s t a g e i n d i s e a s e p r o g r e s s i o n s o a s t o p r e v e n t t h e r e l e a s e o f v i r i o n t o i n f e c t o t h e r c e l l s . B o t h t h e s e a n t i v i r a l s i n h i b i t n e u r a m i n i d a s e ( e l u t i n g e n z y m e ) . H o w e v e r , t h e p r e v a l e n c e o f o s e l t a m i v i r r e s i s t a n t ( 0 . 5 % ) p a n d e m i c ( H 1 N 1 ) 2 0 0 9 h a s b e e n r e p o r t e d . T h e n o v e l s t r a i n s w i t h t h i s r e s i s t a n c e h a v e b e e n r e p o r t e d i n U S , C a n a d a , J a p a n , D e n m a r k a n d H o n g k o n g . ( G r a i t c e r e t a l . , 2 0 0 9 ) . A s a p a r t o f p a n d e m i c p l a n n i n g , s p l i t v i r i o n v a c c i n e g r o w n i n e g g s a n d a d j u v a n t e d w i t h A S O 3 , a n o i l - i n - w a t e r a d j u v a n t c o n t a i n i n g s q u a l e n e a n d w h o l e - c e l l , u n a d j u v a n t e d v a c c i n e g r o w n i n V e r o c e l l s h a v e b e e n t r i e d i n U K . ( A n d r e w s e t a l . , 2 0 1 1 ) . T h e A S O 3 a d j u v a n t p a n d e m i c ( H 1 N 1 ) 2 0 0 9 v a c c i n e h a v e b e e n f o u n d e f f e c t i v e i n p r e v e n t i n g p a n d e m i c ( H 1 N 1 ) 2 0 0 9 d i s e a s e . I n f l u e n z a A ( H 1 N 1 ) 2 0 0 9 M o n o v a l e n t V a c c i n e b y S a n o f i P a s t e u r , N o v a r t i s , C S L L i m i t e d a n d I n f l u e n z a A ( H 1 N 1 ) 2 0 0 9 M o n o v a l e n t V a c c i n e L i v e , I n t r a n a s a l b y M e d I m m u n e , L L C h a v e b e e n a p p r o v e d b y C D C . T h e e f f o r t s t o c u r t a i l a n d c u r b t h e r a p i d g l o b a l s p r e a d o f i n f l u e n z a v i r u s , h a s b e e n r e l a t i v e l y i n e f f e c t i v e . T h e w i d e s p r e a d u s e o f a n t i v i r a l a g e n t s h a s l e d t o t h e e m e r g e n c e o f d r u g r e s i s t a n c e i n A H 1 N 1 . T h u s , d e v e l o p m e n t o f e f f e c t i v e a n d s p e c i f i c v a c c i n e s a g a i n s t t h i s v i r u s i s a k e y c o n c e r n . ( T a n g e t a l . , 2 0 1 0 ) . D i f f e r e n t t e c h n o l o g i e s a r e b e i n g t h o u g h t o f a n d e x p l o r e d i n t h i s c o n t e x t . I n a s t u d y , r e s e a r c h e r s o b s e r v e d i n h i b i t o r y e f f e c t o f S e r u m A m y l o i d P c o m p o n e n t ( S A P ) o n i n f l u e n z a A v i r u s . ( H o r v á t h e t a l . , 2 0 0 1 ) S A P b i n d s i n v i t r o C a ( 2 + ) - d e p e n d e n t l y t o s e v e r a l l i g a n d s i n c l u d i n g o l i g o s a c c h a r i d e s w i t h t e r m i n a l m a n n o s e a n d g a l a c t o s e , s u g g e s t i v e o f t h e i r r o l e a s S A P b i n d i n g s i t e s . T h e s t u d i e s e v i d e n c e d t h e p o t e n t i a l o f i n t r a n a s a l a d m i n i s t e r e d S A P f o r p r o p h y l a c t i c t r e a t m e n t o f i n f l u e n z a . F u r t h e r , t h e s o l u b l e , m u l t i m e r i c f o r m s o f t h e 2 0 0 9 A ( H 1 N 1 ) H A ( s H A ) a n d N A ( s N A ) s u r f a c e g l y c o p r o t e i n s u s i n g a v i r u s - f r e e m a m m a l i a n e x p r e s s i o n s y s t e m h a v e a l s o b e e n e v a l u a t e d f o r t h e i r e f f i c a c y a s v a c c i n e s i n f e r r e t s . T h e c o - a d m i n i s t r a t i o n o f b o t h a n t i g e n s w e r e f o u n d t o i n c r e a s e t h e H A - s p e c i f i c b u t n o t t h e N A - s p e c i f i c r e s p o n s e s . T h e i n v e s t i g a t i o n s d e m o n s t r a t e d t h e v a c c i n e p o t e n t i a l o f m u l t i m e r i c H A a n d N A e c t o d o m a i n s . T h e m a s s p r o d u c t i o n o f t h e s e d o m a i n s h a s b e e n d o c u m e n t e d t o b e e a s y , r a p i d , f l e x i b l e , a n d s a f e . T h e i n c l u s i o n o f N A i n i n f l u e n z a v a c c i n e i s t h o u g h t t o r e d u c e t h e H A d o s e a n d b r o a d e n t h e p r o t e c t i v e i m m u n i t y . ( B o s c h e t a l . , 2 0 1 0 ) . A s i t i s e v i d e n t t h a t t h e p a n d e m i c H 1 N 1 h a s c r o s s e d t h e s p e c i e s b a r r i e r s a n d i n f e c t e d t u r k e y s a n d s w i n e i n s e v e r a l c o u n t r i e s , t h e d e v e l o p m e n t o f e f f e c t i v e S a w h n e y e t a l . , 2 0 1 2 J o u r n a l o f R e s e a r c h i n B i o l o g y ( 2 0 1 2 ) 2 ( 8 ) : 6 9 6 - 7 0 3 6 9 8